La chiesa di San Pietro a Gubbio risale almeno alla metà del XI secolo. L’edificio appartenne inizialmente ai Benedettini Cassinesi, ai quali si sostituirono nel 1519 i Benedettini Olivetani.
La facciata della chiesa presenta le tracce di diversi interventi. Nella parte inferiore il portale è affiancato da quattro arcate cieche poggianti su semicolonne coronate da capitelli corinzi (VIII – IX sec.). Le quattro colonne probabilmente sorreggevano una galleria aperta poi demolita. Nella parte superiore sono visibili le tracce del rosone centrale trecentesco, ora tamponato, e due finestre rettangolari cinquecentesche. Sulla destra sono inserite piccole mensole decorate con motivi animali e fitomorfi.
L’interno è a navata unica e conserva la conformazione conferita nel Cinquecento.
Fra le opere d’arte conservate spicca in controfacciata il maestoso organo maggiore, opera di V. Beltrami, con ornamento di Antonio e Giambattista Maffei (1580-1585). Nella chiesa sono conservati dipinti di Virgilio Nucci, Francesco Allegrini, Raffaellino del Colle, Rutilio Manetti e Agostino Tofanelli.